Combattre les germes pathogènes, telle est la mission des molécules antibiotiques. Mais chaque médaille ayant un revers, l’action des antibiotiques ne se limite pas aux micro-organismes infectieux : ils endommagent également « les bonnes bactéries » présentes dans le tube digestif. Le désordre (ou dysbiose) en résultant ou flore intestinale provoque des maux de ventre, des nausées ou des diarrhées. Dans certains cas, ces désagréments s’arrêtent dès la fin du traitement. Dans d’autres, ils peuvent perdurer le temps que la flore intestinale se reconstitue complètement, ce qui varie de trois semaines à deux mois, voire plus.

Pour les contrecarrer, il est possible d’aider le microbiote à se reconstituer en associant des probiotiques aux antibiotiques pendant toute la durée de l’antibiothérapie et de prolonger leur prise plusieurs semaines après la fin du traitement. Les plus préconisés sont Saccharomyces boulardii CNCM I-745.